Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc88cQ6VGS5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc88cQ6VGS5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms