Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med16Q6PGF3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms