Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc82Q6PG04 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc82Q6PG04 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc82Q6PG04 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc82Q6PG04 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc82Q6PG04 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc82Q6PG04 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc82Q6PG04 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc82Q6PG04 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc82Q6PG04 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc82Q6PG04 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc82Q6PG04 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc82Q6PG04 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc82Q6PG04 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms