Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scaf4Q6PFF0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf4Q6PFF0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms