Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ6

Fbxo42, F-box only protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo42Q6PDJ6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fbxo42Q6PDJ6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo42Q6PDJ6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo42Q6PDJ6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo42Q6PDJ6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo42Q6PDJ6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo42Q6PDJ6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo42Q6PDJ6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo42Q6PDJ6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo42Q6PDJ6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo42Q6PDJ6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo42Q6PDJ6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo42Q6PDJ6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo42Q6PDJ6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo42Q6PDJ6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo42Q6PDJ6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo42Q6PDJ6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo42Q6PDJ6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo42Q6PDJ6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo42Q6PDJ6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo42Q6PDJ6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo42Q6PDJ6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo42Q6PDJ6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo42Q6PDJ6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo42Q6PDJ6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fbxo42Q6PDJ6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fbxo42Q6PDJ6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms