Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Gapvd1Q6PAR5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gapvd1Q6PAR5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms