Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cyp2d40Q6P8N9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms