Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smchd1Q6P5D8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smchd1Q6P5D8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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