Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrimpolQ6P1E7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrimpolQ6P1E7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms