Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Asic1Q6NXK8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Asic1Q6NXK8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Asic1Q6NXK8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Asic1Q6NXK8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Asic1Q6NXK8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Asic1Q6NXK8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Asic1Q6NXK8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Asic1Q6NXK8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Asic1Q6NXK8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Asic1Q6NXK8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Asic1Q6NXK8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Asic1Q6NXK8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Asic1Q6NXK8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Asic1Q6NXK8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Asic1Q6NXK8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Asic1Q6NXK8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Asic1Q6NXK8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms