Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HelbQ6NVF4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HelbQ6NVF4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HelbQ6NVF4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
HelbQ6NVF4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HelbQ6NVF4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HelbQ6NVF4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HelbQ6NVF4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HelbQ6NVF4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HelbQ6NVF4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HelbQ6NVF4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HelbQ6NVF4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HelbQ6NVF4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HelbQ6NVF4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HelbQ6NVF4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HelbQ6NVF4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HelbQ6NVF4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HelbQ6NVF4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HelbQ6NVF4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HelbQ6NVF4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HelbQ6NVF4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HelbQ6NVF4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HelbQ6NVF4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HelbQ6NVF4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HelbQ6NVF4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HelbQ6NVF4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms