Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr44Q6NVE8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms