Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdcd11Q6NS46 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdcd11Q6NS46 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms