Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms