Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arhgap20Q6IFT4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arhgap20Q6IFT4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms