Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg9bQ6EBV9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg9bQ6EBV9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms