Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Smarca2Q6DIC0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Smarca2Q6DIC0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms