Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nop58Q6DFW4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nop58Q6DFW4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms