Protein–RNA interactions for Protein: Q6A068

Cdc5l, Cell division cycle 5-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc5lQ6A068 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cdc5lQ6A068 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc5lQ6A068 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms