Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thsd7aQ69ZU6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thsd7aQ69ZU6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thsd7aQ69ZU6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Thsd7aQ69ZU6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thsd7aQ69ZU6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thsd7aQ69ZU6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thsd7aQ69ZU6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thsd7aQ69ZU6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thsd7aQ69ZU6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thsd7aQ69ZU6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thsd7aQ69ZU6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thsd7aQ69ZU6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Thsd7aQ69ZU6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thsd7aQ69ZU6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thsd7aQ69ZU6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thsd7aQ69ZU6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thsd7aQ69ZU6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thsd7aQ69ZU6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thsd7aQ69ZU6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thsd7aQ69ZU6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thsd7aQ69ZU6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thsd7aQ69ZU6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thsd7aQ69ZU6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thsd7aQ69ZU6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms