Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sbno1Q689Z5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
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Sbno1Q689Z5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms