Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ca4Q64444 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ca4Q64444 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms