Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf1Q64213 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sf1Q64213 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf1Q64213 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf1Q64213 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf1Q64213 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf1Q64213 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf1Q64213 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf1Q64213 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf1Q64213 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf1Q64213 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf1Q64213 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf1Q64213 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf1Q64213 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf1Q64213 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf1Q64213 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf1Q64213 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf1Q64213 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf1Q64213 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf1Q64213 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf1Q64213 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf1Q64213 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf1Q64213 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf1Q64213 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf1Q64213 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms