Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sall3Q62255 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sall3Q62255 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms