Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Six2Q62232 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Six2Q62232 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Six2Q62232 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Six2Q62232 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Six2Q62232 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Six2Q62232 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Six2Q62232 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six2Q62232 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six2Q62232 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six2Q62232 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six2Q62232 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Six2Q62232 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms