Protein–RNA interactions for Protein: Q62167

Ddx3x, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx3xQ62167 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx3xQ62167 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx3xQ62167 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms