Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhocQ62159 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhocQ62159 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhocQ62159 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhocQ62159 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhocQ62159 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms