Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Prm3Q62100 Tceal9-202ENSMUST00000113115 888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Gm26619-201ENSMUST00000180396 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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Prm3Q62100 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Prm3Q62100 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Prm3Q62100 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Prm3Q62100 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Prm3Q62100 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Prm3Q62100 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Prm3Q62100 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Prm3Q62100 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Prm3Q62100 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Prm3Q62100 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Prm3Q62100 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Prm3Q62100 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Prm3Q62100 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Prm3Q62100 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prm3Q62100 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms