Protein–RNA interactions for Protein: Q61923

Kcna6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna6Q61923 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcna6Q61923 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcna6Q61923 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcna6Q61923 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcna6Q61923 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcna6Q61923 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcna6Q61923 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcna6Q61923 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcna6Q61923 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms