Protein–RNA interactions for Protein: Q61286

Tcf12, Transcription factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf12Q61286 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tcf12Q61286 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms