Protein–RNA interactions for Protein: Q61189

Clns1a, Methylosome subunit pICln, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clns1aQ61189 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clns1aQ61189 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms