Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trpc6Q61143 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc6Q61143 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms