Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TmpoQ61033 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TmpoQ61033 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms