Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Foxg1Q60987 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Foxg1Q60987 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms