Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
JrkQ60976 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
JrkQ60976 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
JrkQ60976 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
JrkQ60976 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
JrkQ60976 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
JrkQ60976 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms