Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik1Q60934 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms