Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tcf4Q60722 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcf4Q60722 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms