Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmelQ60696 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmelQ60696 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmelQ60696 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmelQ60696 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmelQ60696 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PmelQ60696 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms