Protein–RNA interactions for Protein: Q60648

Gm2a, Ganglioside GM2 activator, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2aQ60648 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2aQ60648 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2aQ60648 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2aQ60648 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2aQ60648 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2aQ60648 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2aQ60648 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2aQ60648 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2aQ60648 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2aQ60648 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2aQ60648 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2aQ60648 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2aQ60648 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2aQ60648 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2aQ60648 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2aQ60648 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2aQ60648 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2aQ60648 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2aQ60648 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm2aQ60648 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm2aQ60648 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm2aQ60648 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm2aQ60648 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm2aQ60648 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm2aQ60648 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms