Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sin3aQ60520 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sin3aQ60520 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms