Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp13a3Q5XF89 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp13a3Q5XF89 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms