Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4H9

Ncoa4, Nuclear receptor coactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa4Q5U4H9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncoa4Q5U4H9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ncoa4Q5U4H9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ncoa4Q5U4H9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ncoa4Q5U4H9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncoa4Q5U4H9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncoa4Q5U4H9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncoa4Q5U4H9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncoa4Q5U4H9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncoa4Q5U4H9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncoa4Q5U4H9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncoa4Q5U4H9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncoa4Q5U4H9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncoa4Q5U4H9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncoa4Q5U4H9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncoa4Q5U4H9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncoa4Q5U4H9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncoa4Q5U4H9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncoa4Q5U4H9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ncoa4Q5U4H9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ncoa4Q5U4H9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ncoa4Q5U4H9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ncoa4Q5U4H9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ncoa4Q5U4H9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ncoa4Q5U4H9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms