Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

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Length 725 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rabl6Q5U3K5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rabl6Q5U3K5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms