Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med13Q5SWW4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med13Q5SWW4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms