Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlha9Q5RJB0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms