Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rtp3Q5QGU6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms