Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Trim41Q5NCC3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Trim41Q5NCC3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms