Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufaf2Q59J78 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf2Q59J78 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms