Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA7

Snx33, Sorting nexin-33, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx33Q4VAA7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx33Q4VAA7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Snx33Q4VAA7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx33Q4VAA7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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