Protein–RNA interactions for Protein: Q4QRL3

Ccdc88b, Coiled-coil domain-containing protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88bQ4QRL3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc88bQ4QRL3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc88bQ4QRL3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc88bQ4QRL3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc88bQ4QRL3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc88bQ4QRL3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc88bQ4QRL3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc88bQ4QRL3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc88bQ4QRL3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc88bQ4QRL3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc88bQ4QRL3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc88bQ4QRL3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc88bQ4QRL3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc88bQ4QRL3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc88bQ4QRL3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc88bQ4QRL3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc88bQ4QRL3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc88bQ4QRL3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc88bQ4QRL3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc88bQ4QRL3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc88bQ4QRL3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc88bQ4QRL3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc88bQ4QRL3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc88bQ4QRL3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc88bQ4QRL3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms